W 1798 armie francuskie podbiły Szwajcarię narzucając nową ujednoliconą konstytucję, osłabiającą kantony oraz wzmacniającą przywództwo centralny. Okres ten (1798-1803) zwany jest Republiką Helwecką. Jednakże struktura ten zniszczył wielowiekowe tradycje kulturowe oraz był niezwykle niepopularny wśród Szwajcarów. Kiedy wybuchła wojna, Szwajcaria stała się areną walk pośrodku Francją i Austrią oraz Rosją. Pojawiły się ponadto dwójka frakcje wśród Szwajcarów – "Republikanów" będących zwolennikami nowego porządku także "Federalistów" chcących powrotu do systemu federacyjnego opartego na szerokiej autonomii kantonów. Po spotkaniu zorganizowanym wskroś Napoleona do wnętrza 1803 do wnętrza Paryżu oba stronnictwa doszły do porozumienia co znalazło wyraz wewnątrz podpisaniu tzw. Aktu Mediacyjnego przywracającego do wnętrza znacznym stopniu struktura federacyjny. Kongres wiedeński potwierdził neutralność Szwajcarii, do której przyłączono ostatnie trzy kantony: Valais, Neuchâtel oraz Genewa.